Церковь заложена в память Святых и праведных пророка Захарии и Елизаветы в Стародубе. Была закрыта в 1873 году вместе с церковью Иоанна Богослова как бесприходная. По мнению стародубских краеведов, она располагалась недалеко от бывшего душевого павильона, в районе переулка Чкалова. В ГАБО есть метрические книги храма с 1798 по 1918 годы.
***
Закладная табличка 1773 года храма во имя пророка Захария и Елизаветы. Хранится в Стародубском краеведческом музее, инвентарный номер СКМ 1-20-А. Поступила в фонды Стародубского музея в группе предметов в 1972 году. Текст из 20 углубленных строк нанесен с одной стороны прямоугольной медной пластины. Сохранность вполне удовлетворительная: поверхность незначительно окислена и деформирована, нижний правый угол загнут вверх.
Во имя Отца и Сына и Святого Духа / / основалась сия церковь в честь и память / / святых и праведных пророка Захарии и Елиза / / веты при державе Благочестивейшей / / и Самодержавнейшей Великой // Государыни и императрицы Екатерины / / Алексеевны самодержицы Всероссий / / ской и при наследнике ее Благоверном / / Государе Цесаревиче и Великом Князе / / Павле Петровиче благословением преосвященней / / шего правительствующего синода и преосвя / / щенного Феофила епископа Черниговского / / и Новагородка Северского тщанием и коизто // м хорунжего полкового господина Захарии / / Спиридоновича Ширая и супруги его Марии / / Романсены и чад их и положены суть / / здесь мощи святого Сергия послушливого / / протопопом стародубовским Димитрием / / Зубрицким в лето о рождестве Христовом / / 1773 года мая дня
***
Награжден скуфьею за труды на пастырском поприще священник Захарие-Елисаветинской церкви города Стародуба Александр Левицкий.
Черниговские епархиальные известия, № 6, 1904 год.
***
Алфавитный список церквей Черниговской епархии.
Цель составления настоящего списка - дать хотя краткие сведения, в виде настольного справочника, об историческом прошлом всех церквей Черниговской епархии, дать возможность иметь представление о том, насколько та или иная церковь может представлять интерес в архитектурном отношении и можно ли рассчитывать найти в церкви хотя некоторые памятники старины. Материалом для составления настоящего списка послужили официальные документы церквей так называемые клировыя ведомости или ведомости о церкви. В список вносилось название села или города, в честь какого события или святого посвящен престол, каменная церковь или деревянная, год постройки церкви, кем церковь построена, если строитель ее был более или менее известным лицом. Церкви построенные до начала XIX века и затем перестраивавшиеся также отмечались, чтобы знать, что первоначальной конструкции церкви видеть уже нельзя. О тех приходских церквах, которые построены в XIX веке на место существовавших прежде, или обозначены что они "построены когда и кем неизвестно", отмечалось, с каких годов имеются при них документы, именно метрические или исповедные книги. Наконец, делались отметки и о тех церквах, которые построены на место сгоревших и где едва ли уже можно рассчитывать на нахождение памятников церковной старины. Ручаться за полную точность предлагаемых сведений, к сожалению, нельзя, так как материал для них – клировые ведомости составляются очень кратко и неполно; особенно это относится к перестройкам, расширению церквей и пристройкам колоколен.
Стародубский уезд. Стародуб, Захарие-Елизаветинской, деревянной постройки 1773 года хорунжием Захарием Шираем.
Труды Черниговской губернской архивной комиссии 1906-1908 годы, выпуск 7.